Ασφαλώς, δεν θα πρέπει να παραγνωρίζεται ο καθοριστικός ρόλος που παίζουν τα λιμάνια για τον κλάδο της επιβατηγού ναυτιλίας και ιδιαίτερα της ακτοπλοΐας, με άμεσες συνέπειες για την ανάπτυξη της νησιωτικής Ελλάδας. Το θέμα επισημαίνει εμφατικά ο κ. Σακέλλης, Πρόεδρος του Συνδέσμου Επιχειρήσεων Επιβατηγού Ναυτιλίας, σημειώνοντας ότι η ανταγωνιστικότητα του κλάδου δεν εξαρτάται μόνο από την ποιότητα των πλοίων και των υπηρεσιών που προσφέρουν οι ακτοπλοϊκές εταιρείες, αλλά και από την ποιότητα των λιμενικών υποδομών. Εκφράζοντας απογοήτευση για την ακολουθούμενη πολιτική, σημειώνει πως «Σε ό,τι αφορά την ακτοπλοΐα, διαχρονικά έχουμε διαπιστώσει πλήρη αδιαφορία και αδυναμία λήψης σωστών αποφάσεων. Τα λιμάνια των νησιών σαφώς παρουσιάζουν προβλήματα, τα οποία επηρεάζουν το επίπεδο των ακτοπλοϊκών υπηρεσιών, αλλά και το κόστος των εισιτηρίων, αφού σε πολλές περιπτώσεις δεν μπορούν να εξυπηρετηθούν τα ήδη δρομολογημένα πλοία, με αποτέλεσμα να είναι αναγκαία η δρομολόγηση επιπλέον πλοίων. Άλλο σοβαρό θέμα είναι η ύπαρξη περισσοτέρων του ενός λιμανιού στο ίδιο νησί, με αποτέλεσμα τα πλοία να αναγκάζονται να εκτελούν δρομολόγια που επηρεάζουν αρνητικά τη συχνότητα των δρομολογίων, το κόστος εκμετάλλευσης και τελικά την τιμή των εισιτηρίων».
Ο Πρόεδρος του ΣΕΕΝ καταγγέλλει μάλιστα κακό σχεδιασμό σε ό,τι αφορά έργα που έχουν εκτελεστεί, ενώ προειδοποιεί ότι τα λάθη συνεχίζονται. «Στον σχεδιασμό κυριαρχούν πολιτικά κριτήρια, με αποτέλεσμα πολλά έργα να δημιουργούν αντί να λύνουν προβλήματα».
Ως χαρακτηριστικά παραδείγματα αναφέρει τα έργα που εκτελέστηκαν στην Τήνο, στην Κάσο, στην Κάλυμνο, αλλά και πρόσφατα στον Αϊ-Στράτη, ενώ επισημαίνει και περιπτώσεις κατασκευής λιμανιών χωρίς να έχουν μελετηθεί οι όροι και οι προϋποθέσεις αξιοποίησής τους, με αποτέλεσμα να μη χρησιμοποιούνται. Ελπίδα ωστόσο για την αλλαγή αυτής της κατάστασης δημιουργεί η απόφαση του υπουργού Ναυτιλίας να συμμετέχει η Ένωση Πλοιάρχων στον σχεδιασμό και στον προγραμματισμό των λιμενικών έργων, για την οποία ο κ. Σακέλλης εκφράζει την ικανοποίησή του. Καταλήγοντας, επισημαίνει ότι η ανάπτυξη των λιμανιών είναι καθοριστικός, αλλά όχι ο μοναδικός παράγοντας που επηρεάζει τον κλάδο. «Εξ ίσου σημαντική είναι η κατανόηση της μεγάλης σημασίας της επιβατηγού ναυτιλίας, ιδιαίτερα της ακτοπλοΐας, και η περαιτέρω απελευθέρωση του κλάδου. Το 95% της επιβατικής κίνησης στην ακτοπλοΐα εξυπηρετείται από ελεύθερες δρομολογήσεις των ιδιωτικών εταιρειών, οι οποίες πρέπει να λειτουργούν σε σαφές και απελευθερωμένο περιβάλλον για να ενθαρρυνθούν οι επενδύσεις οι οποίες θα εξασφαλίσουν τις καλές υπηρεσίες που ήδη προσφέρονται και βέβαια για να τις βελτιώσουν».